Традиционными жилищами айнов были землянки. В зависимости от эпохи и региона они варьировались по форме, размерам и внутреннему устройству. Землянки строились на склонах гор, с заветренной стороны. Непременным условием являлось наличие невдалеке реки и леса. Айны избегали селиться в междуречье, у подножия гор, опасаясь обвалов и наводнений. В поселках («котан»), как правило, находилось по несколько землянок. В землянке жили члены одной семьи, и в зависимости от их количества помещения были меньше или больше.
Для сооружения землянки вырывалась яма глубиной от 1 до 1,6 м. Землю долбили кольями или заостренными палками, а вынимали гребешковыми раковинами. В середине ямы определялось место для очага, который имел продолговатую форму. По краям ямы на поверхности земли ставили четыре столба, столько же устанавливалось внутри. Внутренние столбы выполняли функции несущих опор крыши, а наземные связывались вместе, образовывая конек; между ними и четырехугольником нижних столбов получался треугольный остов крыши. На внутренние столбы клали поперечные балки. Входное отверстие делалось в стене, обращенной на юг. Выходу на поверхность предшествовал коридор, из которого вниз шли выдолбленные в земле ступеньки (затем стали употреблять лестницу). Наверху делалось отверстие для дыма, затем оно было заменено дымоходом, который выводился в коридор. Айны делали в жилище еще одно отверстие – «окна для духа». Оно располагалось в той стороне землянки, которая была обращена в сторону горы, и имело исключительно важное значение для айнов. Обычно это отверстие было открыто, но в непогоду закрывалось специальной доской или пучками травы. Между лестницей и стеной, в свободном пространстве, размещалась кладовая. Пол в жилище был земляной, утрамбованный, стены обкладывались дерном, корой. На пол айны стелили и травяные циновки. Крыша засыпалась землей. На земляной слой набрасывали траву, дерн, мох.
Летник строился на берегу моря, в той части, где начиналась травяная равнина. Вход жилища был обращен в сторону ближнего леса, а «окно для духа» – в сторону моря. Летний представлял из себя постройку каркасного типа с травяной крышей. Он возводился на заранее утрамбованной площадке, где устанавливалось восемь основных столбов, перекрытия составляли балки. Пространство между балками каркаса заполнялось досками. Поперек стены клали крепежную балку. К дому пристраиваются сени, которые бывают односкатные и двускатные. Здесь хранились продукты.
Рядом с айнским жилищем находился свайный амбар. Он используется как склад и хранилище продуктов. Делали его из досок, а в более северных районах – из бревен. Кроме того, на Хоккайдо были амбары, обшитые корой.
Слева от дома располагалась привязь для собак. Перед «окном для духа» было место для домашнего алтаря, где ставили заструженные палочки («инау»), совершали религиозные обряды. Рядом с ним, немного ближе к дому, ставился домик для медведя, где содержался медвежонок, иногда лисица или барсук. Перед входом находилось место для золы и для мусора.
Из построек специального назначения у айнов существовал охотничий домик. На Хоккайдо он был односкатный, на Сахалине – двускатный. В охотничьем домике зимой хранили добычу и пережидали непогоду. Летом на побережье ставили погосты для заготовки продуктов на зиму (сушила, вешала).